Les inconvénient

Les conditions existantes à l'intérieur du système de l'hydroculture (la présence d'engrais tout comme une humidité de l'air élevée), produisent un environnement qui favorise la croissance de salmonelles.



Un autre inconvénient est le cas d'agents pathogènes comprenant la pourriture des racines à la suite de la verticilliose qui sont dûs à une humidité élevée appportée par une hydroculture et une dilution sur la terre. De plus les plantes provenant de l'hydroculture ont besoin d'autres engrais et d'autres systèmes de sécurité en ce qui concerne les récipients.